Protein–RNA interactions for Protein: Q12979

ABR, Active breakpoint cluster region-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRQ12979 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
ABRQ12979 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABRQ12979 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABRQ12979 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABRQ12979 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABRQ12979 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABRQ12979 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABRQ12979 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABRQ12979 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABRQ12979 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABRQ12979 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABRQ12979 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABRQ12979 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABRQ12979 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABRQ12979 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABRQ12979 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABRQ12979 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABRQ12979 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABRQ12979 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ABRQ12979 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABRQ12979 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABRQ12979 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABRQ12979 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABRQ12979 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABRQ12979 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABRQ12979 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABRQ12979 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABRQ12979 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABRQ12979 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABRQ12979 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABRQ12979 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABRQ12979 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ABRQ12979 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ABRQ12979 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ABRQ12979 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
ABRQ12979 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
ABRQ12979 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABRQ12979 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABRQ12979 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ABRQ12979 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABRQ12979 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ABRQ12979 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABRQ12979 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
ABRQ12979 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABRQ12979 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABRQ12979 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABRQ12979 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABRQ12979 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABRQ12979 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABRQ12979 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABRQ12979 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABRQ12979 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
ABRQ12979 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABRQ12979 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABRQ12979 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABRQ12979 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABRQ12979 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABRQ12979 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABRQ12979 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABRQ12979 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABRQ12979 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABRQ12979 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
ABRQ12979 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABRQ12979 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABRQ12979 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABRQ12979 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABRQ12979 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABRQ12979 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABRQ12979 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABRQ12979 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABRQ12979 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABRQ12979 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABRQ12979 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
ABRQ12979 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABRQ12979 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABRQ12979 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABRQ12979 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABRQ12979 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABRQ12979 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABRQ12979 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABRQ12979 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABRQ12979 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABRQ12979 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABRQ12979 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABRQ12979 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABRQ12979 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABRQ12979 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABRQ12979 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ABRQ12979 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ABRQ12979 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABRQ12979 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABRQ12979 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABRQ12979 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABRQ12979 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABRQ12979 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABRQ12979 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABRQ12979 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABRQ12979 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABRQ12979 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ABRQ12979 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms