Protein–RNA interactions for Protein: Q12933

TRAF2, TNF receptor-associated factor 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF2Q12933 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRAF2Q12933 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRAF2Q12933 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
TRAF2Q12933 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF2Q12933 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF2Q12933 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF2Q12933 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF2Q12933 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF2Q12933 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF2Q12933 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF2Q12933 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF2Q12933 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF2Q12933 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF2Q12933 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF2Q12933 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF2Q12933 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF2Q12933 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF2Q12933 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF2Q12933 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF2Q12933 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRAF2Q12933 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF2Q12933 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF2Q12933 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF2Q12933 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF2Q12933 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF2Q12933 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF2Q12933 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRAF2Q12933 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
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