Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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PTPN13Q12923 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
PTPN13Q12923 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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PTPN13Q12923 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
PTPN13Q12923 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
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