Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
LMAN2Q12907 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
LMAN2Q12907 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
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