Protein–RNA interactions for Protein: Q12217

TY1A-BR, Transposon Ty1-BR Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-BRQ12217 MRPL28YDR462W 444 nt6.04□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 YGR035W-AYGR035W-A 222 nt6.04□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 YGR151CYGR151C 336 nt6.04□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 RPS1BYML063W 768 nt6.04□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 HHT2YNL031C 411 nt6.04□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 RNH201YNL072W 924 nt6.04□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 RPL5YPL131W 894 nt6.04□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 PRP3YDR473C 1410 nt6.04□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 IRC5YFR038W 2562 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 UGA1YGR019W 1416 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 TGA1tA(UGC)A 73 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 DJP1YIR004W 1299 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 YJL182CYJL182C 318 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 POP3YNL282W 588 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 PDX3YBR035C 687 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 RPS11BYBR048W 471 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 SMX3YPR182W 261 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 MET3YJR010W 1536 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 GEF1YJR040W 2340 nt6.03□□□□□ -1.44
TY1A-BRQ12217 GEM1YAL048C 1989 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 ISD11YER048W-A 285 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 AST2YER101C 1293 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 CAB4YGR277C 918 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 YKL044WYKL044W 321 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 YRA2YKL214C 612 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 YML031C-AYML031C-A 336 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 YBL055CYBL055C 1257 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 YPL276WYPL276W 438 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 YPR039WYPR039W 336 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 YPT10YBR264C 600 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 VMS1YDR049W 1899 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 RGD2YFL047W 2145 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 PIG2YIL045W 1617 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 GCR2YNL199C 1605 nt6.02□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 APE1YKL103C 1545 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 YGL072CYGL072C 360 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 EFB1YAL003W 621 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 LSM8YJR022W 330 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 ATG10YLL042C 504 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 AFB1YLR040C 675 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 YLR361C-AYLR361C-A 297 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 YML034C-AYML034C-A 399 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 AAR2YBL074C 1068 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 SOL1YNR034W 966 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 YOR121CYOR121C 306 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 FCY1YPR062W 477 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 SUS1YBR111W-A 291 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 MCP2YLR253W 1710 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 RTC5YOR118W 1704 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 TOS1YBR162C 1368 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 RGD1YBR260C 2001 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 CDC4YFL009W 2340 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 BRE2YLR015W 1518 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 MMT1YMR177W 1533 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 BRE5YNR051C 1548 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 MDH3YDL078C 1032 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 YER137W-AYER137W-A 306 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 SEC53YFL045C 765 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 RPS25AYGR027C 327 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 YIL054WYIL054W 318 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 YIL156W-AYIL156W-A 402 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 YKL065W-AYKL065W-A 222 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 ACS1YAL054C 2142 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 IMP4YNL075W 873 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 RPL18BYNL301C 561 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 ATP3YBR039W 936 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 YPL108WYPL108W 507 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 YPR077CYPR077C 372 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 YBR124WYBR124W 360 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 DBP3YGL078C 1572 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 MOT2YER068W 1764 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 TLC1TLC1 1301 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 FET4YMR319C 1659 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 RIO1YOR119C 1455 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 YHR182C-AYHR182C-A 474 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 RPL39YJL189W 156 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 YKL033W-AYKL033W-A 711 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 OCT1YKL134C 2319 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 BIO3YNR058W 1443 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 GAT2YMR136W 1683 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 YER076CYER076C 909 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 PHO86YJL117W 936 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 RPS6AYPL090C 711 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 AFT2YPL202C 1251 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 RPS6BYBR181C 711 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 MBA1YBR185C 837 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 YBR196C-BYBR196C-B 105 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 MEF1YLR069C 2286 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 POL4YCR014C 1749 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 PAL1YDR348C 1500 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 MPH2YDL247W 1830 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 YDL012CYDL012C 324 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 YER148W-AYER148W-A 579 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-BRQ12217 YFL032WYFL032W 321 nt5.97□□□□□ -1.45
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