Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NCBP1Q09161 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
NCBP1Q09161 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NCBP1Q09161 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms