Protein–RNA interactions for Protein: Q08999

RBL2, Retinoblastoma-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL2Q08999 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RBL2Q08999 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RBL2Q08999 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms