Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PDE4CQ08493 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PDE4CQ08493 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms