Protein–RNA interactions for Protein: Q08289

CACNB2, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB2Q08289 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CACNB2Q08289 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CACNB2Q08289 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CACNB2Q08289 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms