Protein–RNA interactions for Protein: Q08004

BUD20, Bud site selection protein 20, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
BUD20Q08004 RKM3YBR030W 1659 nt6.27□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 YDL007C-AYDL007C-A 258 nt6.27□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 RPA14YDR156W 414 nt6.27□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 YFR034W-AYFR034W-A 288 nt6.27□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 COA1YIL157C 594 nt6.27□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 SDL1YIL167W 633 nt6.27□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 OAR1YKL055C 837 nt6.27□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 YML018CYML018C 1182 nt6.27□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 IRC16YPR038W 360 nt6.27□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 FYV5YCL058C 459 nt6.27□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 YPL109CYPL109C 1974 nt6.27□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 ECM30YLR436C 3825 nt6.26□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 YER175W-AYER175W-A 165 nt6.26□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 YGR151CYGR151C 336 nt6.26□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 YHL018WYHL018W 363 nt6.26□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 QCR10YHR001W-A 234 nt6.26□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 YIR042CYIR042C 711 nt6.26□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 ASK1YKL052C 879 nt6.26□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 PDP3YLR455W 915 nt6.26□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 GRX7YBR014C 612 nt6.26□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 AFT2YPL202C 1251 nt6.26□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 SPN1YPR133C 1233 nt6.26□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 YIL067CYIL067C 2037 nt6.26□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 SPH1YLR313C 1593 nt6.26□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 NOT3YIL038C 2511 nt6.26□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 NUP1YOR098C 3231 nt6.25□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 ILV1YER086W 1731 nt6.25□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 RIX7YLL034C 2514 nt6.25□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 YMR295CYMR295C 594 nt6.25□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 YNL235CYNL235C 432 nt6.25□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 YPL119C-AYPL119C-A 264 nt6.25□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 YBR056W-AYBR056W-A 201 nt6.25□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 NAT3YPR131C 588 nt6.25□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 snR3snR3 194 nt6.25□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 SSF1YHR066W 1362 nt6.25□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 YTP1YNL237W 1380 nt6.25□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 SIT1YEL065W 1887 nt6.25□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 PRT1YOR361C 2292 nt6.25□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 IFM1YOL023W 2031 nt6.25□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 SGE1YPR198W 1632 nt6.25□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 AYT1YLL063C 1425 nt6.25□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 NEL1YHR035W 1893 nt6.24□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 CDC14YFR028C 1656 nt6.24□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 DBP8YHR169W 1296 nt6.24□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 YJL182CYJL182C 318 nt6.24□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 PGU1YJR153W 1086 nt6.24□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 ERD2YBL040C 660 nt6.24□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 YBR126W-AYBR126W-A 207 nt6.24□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 PRP3YDR473C 1410 nt6.24□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 RGP1YDR137W 1992 nt6.24□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 ADE12YNL220W 1302 nt6.24□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 SKY1YMR216C 2229 nt6.23□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 NMD5YJR132W 3147 nt6.23□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 YGR228WYGR228W 345 nt6.23□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 YGR265WYGR265W 411 nt6.23□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 YHR050W-AYHR050W-A 171 nt6.23□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 GLO1YML004C 981 nt6.23□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 YML108WYML108W 318 nt6.23□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 PRX1YBL064C 786 nt6.23□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 PYC2YBR218C 3543 nt6.23□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 EMP65YER140W 1671 nt6.23□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 LYS9YNR050C 1341 nt6.23□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 HES1YOR237W 1305 nt6.23□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 GEF1YJR040W 2340 nt6.22□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 TKL2YBR117C 2046 nt6.22□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 UBC1YDR177W 648 nt6.22□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 AST2YER101C 1293 nt6.22□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 SCS7YMR272C 1155 nt6.22□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 HEM4YOR278W 828 nt6.22□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 HCM1YCR065W 1695 nt6.22□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 CET1YPL228W 1650 nt6.22□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 ARP9YMR033W 1404 nt6.22□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 GLN3YER040W 2193 nt6.21□□□□□ -1.41
BUD20Q08004 MTC2YKL098W 1074 nt6.21□□□□□ -1.42
BUD20Q08004 YEN1YER041W 2280 nt6.21□□□□□ -1.42
BUD20Q08004 TMN2YDR107C 2019 nt6.21□□□□□ -1.42
BUD20Q08004 ERG1YGR175C 1491 nt6.21□□□□□ -1.42
BUD20Q08004 DSF1YEL070W 1509 nt6.2□□□□□ -1.42
BUD20Q08004 YNR073CYNR073C 1509 nt6.2□□□□□ -1.42
BUD20Q08004 ISD11YER048W-A 285 nt6.2□□□□□ -1.42
BUD20Q08004 SCS2YER120W 735 nt6.2□□□□□ -1.42
BUD20Q08004 RPB3YIL021W 957 nt6.2□□□□□ -1.42
BUD20Q08004 YLR466C-BYLR466C-B 117 nt6.2□□□□□ -1.42
BUD20Q08004 YOL134CYOL134C 390 nt6.2□□□□□ -1.42
BUD20Q08004 YNG1YOR064C 660 nt6.2□□□□□ -1.42
BUD20Q08004 YPR174CYPR174C 666 nt6.2□□□□□ -1.42
BUD20Q08004 VBA1YMR088C 1689 nt6.2□□□□□ -1.42
BUD20Q08004 DIA3YDL024C 1407 nt6.19□□□□□ -1.42
BUD20Q08004 ATG1YGL180W 2694 nt6.19□□□□□ -1.42
BUD20Q08004 YFR006WYFR006W 1608 nt6.19□□□□□ -1.42
BUD20Q08004 YCR013CYCR013C 648 nt6.19□□□□□ -1.42
BUD20Q08004 MRPL11YDL202W 750 nt6.19□□□□□ -1.42
BUD20Q08004 SOH1YGL127C 384 nt6.19□□□□□ -1.42
BUD20Q08004 YAL004WYAL004W 648 nt6.19□□□□□ -1.42
BUD20Q08004 HHT2YNL031C 411 nt6.19□□□□□ -1.42
BUD20Q08004 RNH201YNL072W 924 nt6.19□□□□□ -1.42
BUD20Q08004 AIM4YBR194W 372 nt6.19□□□□□ -1.42
BUD20Q08004 HRR25YPL204W 1485 nt6.19□□□□□ -1.42
BUD20Q08004 PMS1YNL082W 2622 nt6.19□□□□□ -1.42
BUD20Q08004 YPR148CYPR148C 1308 nt6.19□□□□□ -1.42
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 25.8 ms