Protein–RNA interactions for Protein: Q07960

ARHGAP1, Rho GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP1Q07960 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGAP1Q07960 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGAP1Q07960 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGAP1Q07960 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGAP1Q07960 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGAP1Q07960 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGAP1Q07960 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGAP1Q07960 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGAP1Q07960 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGAP1Q07960 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGAP1Q07960 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGAP1Q07960 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGAP1Q07960 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGAP1Q07960 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGAP1Q07960 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGAP1Q07960 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGAP1Q07960 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGAP1Q07960 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGAP1Q07960 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGAP1Q07960 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGAP1Q07960 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGAP1Q07960 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGAP1Q07960 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGAP1Q07960 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGAP1Q07960 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGAP1Q07960 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGAP1Q07960 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGAP1Q07960 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGAP1Q07960 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGAP1Q07960 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGAP1Q07960 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGAP1Q07960 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGAP1Q07960 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGAP1Q07960 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGAP1Q07960 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGAP1Q07960 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGAP1Q07960 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGAP1Q07960 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGAP1Q07960 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGAP1Q07960 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGAP1Q07960 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGAP1Q07960 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGAP1Q07960 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARHGAP1Q07960 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGAP1Q07960 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGAP1Q07960 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGAP1Q07960 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGAP1Q07960 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGAP1Q07960 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGAP1Q07960 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGAP1Q07960 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGAP1Q07960 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGAP1Q07960 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGAP1Q07960 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGAP1Q07960 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGAP1Q07960 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGAP1Q07960 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGAP1Q07960 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGAP1Q07960 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGAP1Q07960 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGAP1Q07960 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGAP1Q07960 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGAP1Q07960 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGAP1Q07960 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGAP1Q07960 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGAP1Q07960 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGAP1Q07960 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGAP1Q07960 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGAP1Q07960 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGAP1Q07960 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGAP1Q07960 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGAP1Q07960 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGAP1Q07960 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGAP1Q07960 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGAP1Q07960 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGAP1Q07960 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGAP1Q07960 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGAP1Q07960 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGAP1Q07960 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGAP1Q07960 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGAP1Q07960 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGAP1Q07960 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGAP1Q07960 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGAP1Q07960 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGAP1Q07960 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGAP1Q07960 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGAP1Q07960 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGAP1Q07960 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGAP1Q07960 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGAP1Q07960 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGAP1Q07960 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGAP1Q07960 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ARHGAP1Q07960 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGAP1Q07960 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGAP1Q07960 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGAP1Q07960 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGAP1Q07960 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGAP1Q07960 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGAP1Q07960 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ARHGAP1Q07960 AC005181.1-201ENST00000604782 1256 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms