Protein–RNA interactions for Protein: Q06643

LTB, Lymphotoxin-beta, humanhuman

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBQ06643 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LTBQ06643 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LTBQ06643 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LTBQ06643 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LTBQ06643 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LTBQ06643 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LTBQ06643 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LTBQ06643 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
LTBQ06643 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
LTBQ06643 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LTBQ06643 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LTBQ06643 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LTBQ06643 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LTBQ06643 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LTBQ06643 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LTBQ06643 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LTBQ06643 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LTBQ06643 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LTBQ06643 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LTBQ06643 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
LTBQ06643 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
LTBQ06643 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
LTBQ06643 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LTBQ06643 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LTBQ06643 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
LTBQ06643 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LTBQ06643 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LTBQ06643 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LTBQ06643 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LTBQ06643 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
LTBQ06643 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
LTBQ06643 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LTBQ06643 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LTBQ06643 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LTBQ06643 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LTBQ06643 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LTBQ06643 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
LTBQ06643 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
LTBQ06643 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LTBQ06643 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LTBQ06643 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LTBQ06643 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
LTBQ06643 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LTBQ06643 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LTBQ06643 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LTBQ06643 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
LTBQ06643 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LTBQ06643 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LTBQ06643 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LTBQ06643 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LTBQ06643 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LTBQ06643 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LTBQ06643 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
LTBQ06643 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LTBQ06643 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LTBQ06643 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LTBQ06643 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
LTBQ06643 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LTBQ06643 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LTBQ06643 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LTBQ06643 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LTBQ06643 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LTBQ06643 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LTBQ06643 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LTBQ06643 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LTBQ06643 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LTBQ06643 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LTBQ06643 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LTBQ06643 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
LTBQ06643 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LTBQ06643 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
LTBQ06643 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LTBQ06643 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LTBQ06643 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LTBQ06643 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LTBQ06643 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LTBQ06643 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LTBQ06643 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
LTBQ06643 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
LTBQ06643 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LTBQ06643 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
LTBQ06643 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
LTBQ06643 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LTBQ06643 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LTBQ06643 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
LTBQ06643 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTBQ06643 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTBQ06643 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTBQ06643 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTBQ06643 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTBQ06643 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTBQ06643 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTBQ06643 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
LTBQ06643 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTBQ06643 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTBQ06643 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTBQ06643 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTBQ06643 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTBQ06643 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
LTBQ06643 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms