Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GABPAQ06546 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GABPAQ06546 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GABPAQ06546 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms