Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
EXOSC9Q06265 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
EXOSC9Q06265 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
EXOSC9Q06265 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EXOSC9Q06265 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EXOSC9Q06265 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EXOSC9Q06265 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
EXOSC9Q06265 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EXOSC9Q06265 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EXOSC9Q06265 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EXOSC9Q06265 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
EXOSC9Q06265 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EXOSC9Q06265 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EXOSC9Q06265 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
EXOSC9Q06265 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EXOSC9Q06265 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EXOSC9Q06265 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EXOSC9Q06265 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
EXOSC9Q06265 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EXOSC9Q06265 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EXOSC9Q06265 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
EXOSC9Q06265 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EXOSC9Q06265 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EXOSC9Q06265 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
EXOSC9Q06265 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
EXOSC9Q06265 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16 ms