Protein–RNA interactions for Protein: Q06033

ITIH3, Inter-alpha-trypsin inhibitor heavy chain H3, humanhuman

Predictions only

Length 890 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITIH3Q06033 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITIH3Q06033 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITIH3Q06033 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ITIH3Q06033 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ITIH3Q06033 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ITIH3Q06033 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITIH3Q06033 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITIH3Q06033 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITIH3Q06033 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITIH3Q06033 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITIH3Q06033 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITIH3Q06033 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ITIH3Q06033 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITIH3Q06033 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ITIH3Q06033 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITIH3Q06033 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ITIH3Q06033 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITIH3Q06033 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITIH3Q06033 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITIH3Q06033 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITIH3Q06033 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITIH3Q06033 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITIH3Q06033 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITIH3Q06033 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITIH3Q06033 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITIH3Q06033 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITIH3Q06033 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ITIH3Q06033 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITIH3Q06033 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITIH3Q06033 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITIH3Q06033 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITIH3Q06033 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITIH3Q06033 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITIH3Q06033 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITIH3Q06033 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITIH3Q06033 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITIH3Q06033 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITIH3Q06033 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITIH3Q06033 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITIH3Q06033 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITIH3Q06033 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITIH3Q06033 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITIH3Q06033 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ITIH3Q06033 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITIH3Q06033 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITIH3Q06033 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITIH3Q06033 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITIH3Q06033 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ITIH3Q06033 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ITIH3Q06033 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITIH3Q06033 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITIH3Q06033 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITIH3Q06033 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITIH3Q06033 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITIH3Q06033 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITIH3Q06033 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITIH3Q06033 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ITIH3Q06033 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ITIH3Q06033 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ITIH3Q06033 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ITIH3Q06033 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ITIH3Q06033 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ITIH3Q06033 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ITIH3Q06033 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ITIH3Q06033 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITIH3Q06033 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITIH3Q06033 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITIH3Q06033 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITIH3Q06033 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITIH3Q06033 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITIH3Q06033 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITIH3Q06033 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITIH3Q06033 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITIH3Q06033 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITIH3Q06033 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITIH3Q06033 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ITIH3Q06033 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITIH3Q06033 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITIH3Q06033 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITIH3Q06033 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITIH3Q06033 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITIH3Q06033 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITIH3Q06033 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITIH3Q06033 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITIH3Q06033 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITIH3Q06033 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ITIH3Q06033 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITIH3Q06033 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ITIH3Q06033 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITIH3Q06033 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITIH3Q06033 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
ITIH3Q06033 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITIH3Q06033 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITIH3Q06033 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITIH3Q06033 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITIH3Q06033 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITIH3Q06033 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITIH3Q06033 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITIH3Q06033 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
ITIH3Q06033 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms