Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
GRIN1Q05586 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GRIN1Q05586 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms