Protein–RNA interactions for Protein: Q05086

UBE3A, Ubiquitin-protein ligase E3A, humanhuman

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE3AQ05086 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
UBE3AQ05086 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE3AQ05086 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms