Protein–RNA interactions for Protein: Q05048

CSTF1, Cleavage stimulation factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF1Q05048 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CSTF1Q05048 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CSTF1Q05048 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.6 ms