Protein–RNA interactions for Protein: Q04837

SSBP1, Single-stranded DNA-binding protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSBP1Q04837 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SSBP1Q04837 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SSBP1Q04837 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms