Protein–RNA interactions for Protein: Q04671

OCA2, P protein, humanhuman

Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OCA2Q04671 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
OCA2Q04671 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
OCA2Q04671 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
OCA2Q04671 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
OCA2Q04671 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
OCA2Q04671 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
OCA2Q04671 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
OCA2Q04671 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
OCA2Q04671 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.76■□□□□ 0.91
OCA2Q04671 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
OCA2Q04671 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
OCA2Q04671 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms