Protein–RNA interactions for Protein: Q03468

ERCC6, DNA excision repair protein ERCC-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC6Q03468 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC37.61■■■■□ 3.61
ERCC6Q03468 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
ERCC6Q03468 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
ERCC6Q03468 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC37.61■■■■□ 3.61
ERCC6Q03468 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
ERCC6Q03468 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
ERCC6Q03468 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
ERCC6Q03468 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
ERCC6Q03468 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC37.6■■■■□ 3.61
ERCC6Q03468 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC37.6■■■■□ 3.61
ERCC6Q03468 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.6■■■■□ 3.61
ERCC6Q03468 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC37.59■■■■□ 3.61
ERCC6Q03468 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
ERCC6Q03468 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC37.59■■■■□ 3.61
ERCC6Q03468 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC37.59■■■■□ 3.61
ERCC6Q03468 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
ERCC6Q03468 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC37.58■■■■□ 3.61
ERCC6Q03468 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
ERCC6Q03468 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
ERCC6Q03468 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
ERCC6Q03468 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
ERCC6Q03468 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
ERCC6Q03468 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC37.58■■■■□ 3.61
ERCC6Q03468 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC37.58■■■■□ 3.61
ERCC6Q03468 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.61
ERCC6Q03468 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
ERCC6Q03468 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.57■■■■□ 3.6
ERCC6Q03468 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
ERCC6Q03468 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
ERCC6Q03468 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC37.57■■■■□ 3.6
ERCC6Q03468 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
ERCC6Q03468 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
ERCC6Q03468 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
ERCC6Q03468 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
ERCC6Q03468 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
ERCC6Q03468 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC37.56■■■■□ 3.6
ERCC6Q03468 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.56■■■■□ 3.6
ERCC6Q03468 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
ERCC6Q03468 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
ERCC6Q03468 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
ERCC6Q03468 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
ERCC6Q03468 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
ERCC6Q03468 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC37.55■■■■□ 3.6
ERCC6Q03468 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC37.55■■■■□ 3.6
ERCC6Q03468 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
ERCC6Q03468 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
ERCC6Q03468 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC37.55■■■■□ 3.6
ERCC6Q03468 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
ERCC6Q03468 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
ERCC6Q03468 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC37.54■■■■□ 3.6
ERCC6Q03468 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC37.54■■■■□ 3.6
ERCC6Q03468 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
ERCC6Q03468 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
ERCC6Q03468 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
ERCC6Q03468 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
ERCC6Q03468 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.53■■■■□ 3.6
ERCC6Q03468 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC37.53■■■■□ 3.6
ERCC6Q03468 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
ERCC6Q03468 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC37.52■■■■□ 3.6
ERCC6Q03468 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
ERCC6Q03468 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
ERCC6Q03468 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
ERCC6Q03468 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
ERCC6Q03468 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
ERCC6Q03468 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
ERCC6Q03468 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
ERCC6Q03468 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
ERCC6Q03468 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
ERCC6Q03468 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC37.51■■■■□ 3.6
ERCC6Q03468 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.59
ERCC6Q03468 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC37.51■■■■□ 3.59
ERCC6Q03468 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.5■■■■□ 3.59
ERCC6Q03468 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC37.5■■■■□ 3.59
ERCC6Q03468 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
ERCC6Q03468 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
ERCC6Q03468 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
ERCC6Q03468 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
ERCC6Q03468 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC37.5■■■■□ 3.59
ERCC6Q03468 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
ERCC6Q03468 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
ERCC6Q03468 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
ERCC6Q03468 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
ERCC6Q03468 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC37.49■■■■□ 3.59
ERCC6Q03468 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC37.49■■■■□ 3.59
ERCC6Q03468 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC37.49■■■■□ 3.59
ERCC6Q03468 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
ERCC6Q03468 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
ERCC6Q03468 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
ERCC6Q03468 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
ERCC6Q03468 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
ERCC6Q03468 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
ERCC6Q03468 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.48■■■■□ 3.59
ERCC6Q03468 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC37.48■■■■□ 3.59
ERCC6Q03468 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
ERCC6Q03468 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
ERCC6Q03468 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC37.47■■■■□ 3.59
ERCC6Q03468 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC37.47■■■■□ 3.59
ERCC6Q03468 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
ERCC6Q03468 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC37.46■■■■□ 3.59
ERCC6Q03468 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC37.46■■■■□ 3.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms