Protein–RNA interactions for Protein: Q02880

TOP2B, DNA topoisomerase 2-beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP2BQ02880 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
TOP2BQ02880 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
TOP2BQ02880 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
TOP2BQ02880 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
TOP2BQ02880 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TOP2BQ02880 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
TOP2BQ02880 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TOP2BQ02880 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TOP2BQ02880 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TOP2BQ02880 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
TOP2BQ02880 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
TOP2BQ02880 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
TOP2BQ02880 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TOP2BQ02880 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
TOP2BQ02880 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
TOP2BQ02880 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
TOP2BQ02880 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
TOP2BQ02880 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
TOP2BQ02880 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
TOP2BQ02880 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
TOP2BQ02880 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
TOP2BQ02880 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
TOP2BQ02880 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
TOP2BQ02880 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
TOP2BQ02880 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
TOP2BQ02880 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
TOP2BQ02880 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
TOP2BQ02880 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
TOP2BQ02880 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
TOP2BQ02880 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
TOP2BQ02880 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC36.37■■■■□ 3.41
TOP2BQ02880 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
TOP2BQ02880 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
TOP2BQ02880 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
TOP2BQ02880 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
TOP2BQ02880 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
TOP2BQ02880 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
TOP2BQ02880 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
TOP2BQ02880 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
TOP2BQ02880 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC36.36■■■■□ 3.41
TOP2BQ02880 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
TOP2BQ02880 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
TOP2BQ02880 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
TOP2BQ02880 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
TOP2BQ02880 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC36.35■■■■□ 3.41
TOP2BQ02880 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
TOP2BQ02880 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
TOP2BQ02880 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
TOP2BQ02880 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TOP2BQ02880 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TOP2BQ02880 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TOP2BQ02880 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TOP2BQ02880 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
TOP2BQ02880 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
TOP2BQ02880 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
TOP2BQ02880 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
TOP2BQ02880 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
TOP2BQ02880 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
TOP2BQ02880 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
TOP2BQ02880 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
TOP2BQ02880 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
TOP2BQ02880 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
TOP2BQ02880 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC36.32■■■■□ 3.4
TOP2BQ02880 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
TOP2BQ02880 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
TOP2BQ02880 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
TOP2BQ02880 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
TOP2BQ02880 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
TOP2BQ02880 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
TOP2BQ02880 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
TOP2BQ02880 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
TOP2BQ02880 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
TOP2BQ02880 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
TOP2BQ02880 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
TOP2BQ02880 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.31■■■■□ 3.4
TOP2BQ02880 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
TOP2BQ02880 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
TOP2BQ02880 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC36.3■■■■□ 3.4
TOP2BQ02880 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
TOP2BQ02880 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
TOP2BQ02880 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
TOP2BQ02880 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
TOP2BQ02880 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
TOP2BQ02880 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
TOP2BQ02880 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
TOP2BQ02880 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.3■■■■□ 3.4
TOP2BQ02880 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
TOP2BQ02880 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
TOP2BQ02880 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
TOP2BQ02880 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
TOP2BQ02880 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
TOP2BQ02880 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
TOP2BQ02880 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
TOP2BQ02880 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
TOP2BQ02880 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
TOP2BQ02880 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
TOP2BQ02880 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
TOP2BQ02880 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
TOP2BQ02880 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
TOP2BQ02880 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms