Protein–RNA interactions for Protein: Q02641

CACNB1, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB1Q02641 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
CACNB1Q02641 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 AL157938.2-209ENST00000589128 792 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 AL133445.2-201ENST00000611191 527 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CACNB1Q02641 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms