Protein–RNA interactions for Protein: Q02446

SP4, Transcription factor Sp4, humanhuman

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP4Q02446 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SP4Q02446 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SP4Q02446 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SP4Q02446 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SP4Q02446 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SP4Q02446 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SP4Q02446 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SP4Q02446 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SP4Q02446 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SP4Q02446 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SP4Q02446 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SP4Q02446 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SP4Q02446 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SP4Q02446 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SP4Q02446 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SP4Q02446 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SP4Q02446 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SP4Q02446 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SP4Q02446 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SP4Q02446 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SP4Q02446 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SP4Q02446 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SP4Q02446 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SP4Q02446 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SP4Q02446 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SP4Q02446 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SP4Q02446 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SP4Q02446 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SP4Q02446 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SP4Q02446 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SP4Q02446 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SP4Q02446 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SP4Q02446 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SP4Q02446 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SP4Q02446 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SP4Q02446 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SP4Q02446 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SP4Q02446 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SP4Q02446 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SP4Q02446 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SP4Q02446 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SP4Q02446 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SP4Q02446 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SP4Q02446 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SP4Q02446 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SP4Q02446 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SP4Q02446 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SP4Q02446 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SP4Q02446 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SP4Q02446 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SP4Q02446 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SP4Q02446 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SP4Q02446 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SP4Q02446 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SP4Q02446 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SP4Q02446 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SP4Q02446 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SP4Q02446 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
SP4Q02446 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SP4Q02446 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SP4Q02446 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SP4Q02446 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SP4Q02446 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SP4Q02446 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SP4Q02446 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SP4Q02446 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SP4Q02446 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SP4Q02446 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SP4Q02446 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SP4Q02446 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SP4Q02446 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SP4Q02446 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SP4Q02446 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SP4Q02446 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SP4Q02446 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SP4Q02446 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SP4Q02446 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SP4Q02446 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SP4Q02446 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SP4Q02446 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SP4Q02446 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SP4Q02446 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SP4Q02446 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SP4Q02446 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SP4Q02446 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SP4Q02446 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SP4Q02446 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SP4Q02446 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SP4Q02446 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SP4Q02446 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SP4Q02446 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SP4Q02446 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SP4Q02446 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SP4Q02446 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SP4Q02446 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SP4Q02446 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SP4Q02446 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SP4Q02446 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SP4Q02446 C19orf67-203ENST00000548523 1427 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SP4Q02446 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms