Protein–RNA interactions for Protein: Q01668

CACNA1D, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1D, humanhuman

Predictions only

Length 2,161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1DQ01668 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CACNA1DQ01668 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CACNA1DQ01668 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms