Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SCN7AQ01118 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCN7AQ01118 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCN7AQ01118 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCN7AQ01118 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SCN7AQ01118 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCN7AQ01118 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCN7AQ01118 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCN7AQ01118 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCN7AQ01118 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCN7AQ01118 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCN7AQ01118 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SCN7AQ01118 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SCN7AQ01118 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCN7AQ01118 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCN7AQ01118 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCN7AQ01118 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCN7AQ01118 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCN7AQ01118 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCN7AQ01118 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCN7AQ01118 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCN7AQ01118 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCN7AQ01118 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SCN7AQ01118 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCN7AQ01118 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCN7AQ01118 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCN7AQ01118 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCN7AQ01118 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCN7AQ01118 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SCN7AQ01118 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCN7AQ01118 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCN7AQ01118 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCN7AQ01118 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCN7AQ01118 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCN7AQ01118 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCN7AQ01118 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SCN7AQ01118 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SCN7AQ01118 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCN7AQ01118 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCN7AQ01118 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCN7AQ01118 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCN7AQ01118 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SCN7AQ01118 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SCN7AQ01118 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SCN7AQ01118 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SCN7AQ01118 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SCN7AQ01118 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SCN7AQ01118 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SCN7AQ01118 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SCN7AQ01118 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCN7AQ01118 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCN7AQ01118 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCN7AQ01118 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCN7AQ01118 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SCN7AQ01118 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCN7AQ01118 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCN7AQ01118 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCN7AQ01118 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCN7AQ01118 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCN7AQ01118 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SCN7AQ01118 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCN7AQ01118 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCN7AQ01118 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCN7AQ01118 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCN7AQ01118 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCN7AQ01118 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCN7AQ01118 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCN7AQ01118 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCN7AQ01118 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
SCN7AQ01118 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCN7AQ01118 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCN7AQ01118 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCN7AQ01118 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCN7AQ01118 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCN7AQ01118 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SCN7AQ01118 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms