Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
SPTBN1Q01082 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SPTBN1Q01082 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms