Protein–RNA interactions for Protein: P86452

ZBED6, Zinc finger BED domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED6P86452 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED6P86452 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED6P86452 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED6P86452 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED6P86452 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED6P86452 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED6P86452 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED6P86452 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED6P86452 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED6P86452 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED6P86452 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ZBED6P86452 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
ZBED6P86452 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
ZBED6P86452 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms