Protein–RNA interactions for Protein: P80217

IFI35, Interferon-induced 35 kDa protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFI35P80217 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFI35P80217 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFI35P80217 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFI35P80217 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFI35P80217 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFI35P80217 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFI35P80217 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFI35P80217 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFI35P80217 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFI35P80217 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
IFI35P80217 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
IFI35P80217 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFI35P80217 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFI35P80217 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFI35P80217 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFI35P80217 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFI35P80217 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFI35P80217 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFI35P80217 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFI35P80217 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFI35P80217 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFI35P80217 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFI35P80217 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFI35P80217 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFI35P80217 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFI35P80217 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFI35P80217 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFI35P80217 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFI35P80217 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
IFI35P80217 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFI35P80217 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFI35P80217 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFI35P80217 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFI35P80217 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFI35P80217 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFI35P80217 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFI35P80217 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFI35P80217 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFI35P80217 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
IFI35P80217 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFI35P80217 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFI35P80217 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFI35P80217 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFI35P80217 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
IFI35P80217 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFI35P80217 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFI35P80217 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFI35P80217 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFI35P80217 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFI35P80217 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFI35P80217 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
IFI35P80217 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFI35P80217 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFI35P80217 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFI35P80217 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFI35P80217 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFI35P80217 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
IFI35P80217 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFI35P80217 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFI35P80217 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFI35P80217 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFI35P80217 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFI35P80217 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFI35P80217 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFI35P80217 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFI35P80217 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
IFI35P80217 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFI35P80217 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFI35P80217 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFI35P80217 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFI35P80217 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFI35P80217 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFI35P80217 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFI35P80217 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFI35P80217 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFI35P80217 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFI35P80217 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFI35P80217 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
IFI35P80217 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
IFI35P80217 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFI35P80217 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFI35P80217 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFI35P80217 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFI35P80217 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFI35P80217 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
IFI35P80217 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFI35P80217 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFI35P80217 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFI35P80217 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFI35P80217 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFI35P80217 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFI35P80217 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFI35P80217 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFI35P80217 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFI35P80217 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFI35P80217 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
IFI35P80217 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFI35P80217 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFI35P80217 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IFI35P80217 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms