Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IRX6P78412 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IRX6P78412 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
IRX6P78412 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IRX6P78412 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
IRX6P78412 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IRX6P78412 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IRX6P78412 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IRX6P78412 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IRX6P78412 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IRX6P78412 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IRX6P78412 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
IRX6P78412 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
IRX6P78412 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
IRX6P78412 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IRX6P78412 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IRX6P78412 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IRX6P78412 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IRX6P78412 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IRX6P78412 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
IRX6P78412 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IRX6P78412 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
IRX6P78412 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IRX6P78412 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
IRX6P78412 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
IRX6P78412 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IRX6P78412 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
IRX6P78412 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IRX6P78412 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
IRX6P78412 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IRX6P78412 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
IRX6P78412 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IRX6P78412 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
IRX6P78412 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
IRX6P78412 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
IRX6P78412 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IRX6P78412 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IRX6P78412 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
IRX6P78412 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IRX6P78412 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
IRX6P78412 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IRX6P78412 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IRX6P78412 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IRX6P78412 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IRX6P78412 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
IRX6P78412 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IRX6P78412 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IRX6P78412 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IRX6P78412 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IRX6P78412 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IRX6P78412 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IRX6P78412 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
IRX6P78412 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IRX6P78412 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
IRX6P78412 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IRX6P78412 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IRX6P78412 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IRX6P78412 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IRX6P78412 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IRX6P78412 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IRX6P78412 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
IRX6P78412 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IRX6P78412 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IRX6P78412 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
IRX6P78412 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
IRX6P78412 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
IRX6P78412 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IRX6P78412 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IRX6P78412 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IRX6P78412 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IRX6P78412 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IRX6P78412 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
IRX6P78412 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IRX6P78412 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IRX6P78412 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IRX6P78412 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IRX6P78412 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IRX6P78412 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IRX6P78412 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IRX6P78412 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IRX6P78412 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
IRX6P78412 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
IRX6P78412 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
IRX6P78412 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
IRX6P78412 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
IRX6P78412 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
IRX6P78412 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
IRX6P78412 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
IRX6P78412 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
IRX6P78412 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
IRX6P78412 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
IRX6P78412 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
IRX6P78412 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
IRX6P78412 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
IRX6P78412 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IRX6P78412 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IRX6P78412 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IRX6P78412 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IRX6P78412 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IRX6P78412 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms