Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SNRPNP63162 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SNRPNP63162 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms