Protein–RNA interactions for Protein: P62891

RPL39, 60S ribosomal protein L39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P62891 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P62891 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P62891 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P62891 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P62891 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P62891 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P62891 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P62891 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P62891 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P62891 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P62891 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P62891 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P62891 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P62891 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P62891 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P62891 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P62891 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P62891 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P62891 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P62891 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P62891 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P62891 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P62891 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P62891 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P62891 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RPL39P62891 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39P62891 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39P62891 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39P62891 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39P62891 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39P62891 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39P62891 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39P62891 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39P62891 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39P62891 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39P62891 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39P62891 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39P62891 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39P62891 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39P62891 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39P62891 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39P62891 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39P62891 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39P62891 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RPL39P62891 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39P62891 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39P62891 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39P62891 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39P62891 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39P62891 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39P62891 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39P62891 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39P62891 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39P62891 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39P62891 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39P62891 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39P62891 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39P62891 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39P62891 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39P62891 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39P62891 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39P62891 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
RPL39P62891 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39P62891 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39P62891 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39P62891 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39P62891 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39P62891 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39P62891 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39P62891 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39P62891 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39P62891 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39P62891 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39P62891 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39P62891 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39P62891 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39P62891 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39P62891 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39P62891 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39P62891 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39P62891 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39P62891 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39P62891 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39P62891 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39P62891 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
RPL39P62891 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL39P62891 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL39P62891 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL39P62891 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL39P62891 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL39P62891 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL39P62891 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL39P62891 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL39P62891 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL39P62891 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL39P62891 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL39P62891 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL39P62891 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL39P62891 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
RPL39P62891 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms