Protein–RNA interactions for Protein: P62888

RPL30, 60S ribosomal protein L30, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL30P62888 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
RPL30P62888 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
RPL30P62888 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPL30P62888 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPL30P62888 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPL30P62888 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPL30P62888 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPL30P62888 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPL30P62888 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPL30P62888 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPL30P62888 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPL30P62888 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPL30P62888 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
RPL30P62888 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL30P62888 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL30P62888 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL30P62888 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL30P62888 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL30P62888 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL30P62888 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL30P62888 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL30P62888 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL30P62888 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL30P62888 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL30P62888 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL30P62888 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL30P62888 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL30P62888 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL30P62888 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL30P62888 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL30P62888 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL30P62888 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL30P62888 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL30P62888 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL30P62888 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
RPL30P62888 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPL30P62888 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPL30P62888 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPL30P62888 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPL30P62888 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPL30P62888 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
RPL30P62888 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPL30P62888 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPL30P62888 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPL30P62888 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPL30P62888 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPL30P62888 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
RPL30P62888 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL30P62888 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL30P62888 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL30P62888 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL30P62888 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL30P62888 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL30P62888 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL30P62888 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL30P62888 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL30P62888 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL30P62888 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL30P62888 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL30P62888 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL30P62888 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL30P62888 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL30P62888 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL30P62888 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL30P62888 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL30P62888 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL30P62888 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL30P62888 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL30P62888 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL30P62888 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
RPL30P62888 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL30P62888 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL30P62888 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL30P62888 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL30P62888 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL30P62888 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL30P62888 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL30P62888 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL30P62888 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL30P62888 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL30P62888 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL30P62888 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL30P62888 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL30P62888 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL30P62888 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL30P62888 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL30P62888 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL30P62888 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL30P62888 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL30P62888 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL30P62888 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL30P62888 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL30P62888 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL30P62888 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL30P62888 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL30P62888 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
RPL30P62888 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPL30P62888 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPL30P62888 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RPL30P62888 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms