Protein–RNA interactions for Protein: P61758

VBP1, Prefoldin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VBP1P61758 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VBP1P61758 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VBP1P61758 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VBP1P61758 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VBP1P61758 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VBP1P61758 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VBP1P61758 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VBP1P61758 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VBP1P61758 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VBP1P61758 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VBP1P61758 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
VBP1P61758 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VBP1P61758 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
VBP1P61758 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VBP1P61758 NPY4R-201ENST00000374312 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VBP1P61758 NPY4R2-201ENST00000576178 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VBP1P61758 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VBP1P61758 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VBP1P61758 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VBP1P61758 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VBP1P61758 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VBP1P61758 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VBP1P61758 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VBP1P61758 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VBP1P61758 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
VBP1P61758 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VBP1P61758 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
VBP1P61758 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VBP1P61758 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VBP1P61758 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VBP1P61758 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VBP1P61758 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VBP1P61758 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VBP1P61758 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VBP1P61758 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VBP1P61758 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VBP1P61758 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VBP1P61758 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VBP1P61758 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VBP1P61758 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VBP1P61758 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VBP1P61758 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
VBP1P61758 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
VBP1P61758 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
VBP1P61758 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
VBP1P61758 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
VBP1P61758 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
VBP1P61758 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VBP1P61758 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VBP1P61758 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VBP1P61758 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VBP1P61758 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VBP1P61758 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VBP1P61758 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VBP1P61758 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VBP1P61758 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VBP1P61758 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VBP1P61758 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VBP1P61758 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VBP1P61758 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VBP1P61758 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VBP1P61758 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VBP1P61758 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
VBP1P61758 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VBP1P61758 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
VBP1P61758 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
VBP1P61758 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VBP1P61758 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VBP1P61758 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VBP1P61758 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VBP1P61758 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
VBP1P61758 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VBP1P61758 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VBP1P61758 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VBP1P61758 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VBP1P61758 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VBP1P61758 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VBP1P61758 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VBP1P61758 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VBP1P61758 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VBP1P61758 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
VBP1P61758 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
VBP1P61758 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VBP1P61758 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VBP1P61758 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VBP1P61758 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VBP1P61758 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VBP1P61758 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VBP1P61758 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VBP1P61758 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VBP1P61758 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VBP1P61758 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
VBP1P61758 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
VBP1P61758 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VBP1P61758 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VBP1P61758 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VBP1P61758 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VBP1P61758 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VBP1P61758 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
VBP1P61758 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms