Protein–RNA interactions for Protein: P61201

COPS2, COP9 signalosome complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS2P61201 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPS2P61201 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPS2P61201 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COPS2P61201 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPS2P61201 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPS2P61201 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPS2P61201 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPS2P61201 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPS2P61201 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
COPS2P61201 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
COPS2P61201 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPS2P61201 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPS2P61201 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COPS2P61201 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPS2P61201 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPS2P61201 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPS2P61201 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPS2P61201 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPS2P61201 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPS2P61201 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPS2P61201 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPS2P61201 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPS2P61201 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPS2P61201 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
COPS2P61201 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPS2P61201 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPS2P61201 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPS2P61201 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COPS2P61201 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPS2P61201 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPS2P61201 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPS2P61201 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPS2P61201 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPS2P61201 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPS2P61201 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPS2P61201 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPS2P61201 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPS2P61201 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPS2P61201 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COPS2P61201 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPS2P61201 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPS2P61201 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPS2P61201 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPS2P61201 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPS2P61201 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPS2P61201 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
COPS2P61201 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPS2P61201 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPS2P61201 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
COPS2P61201 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPS2P61201 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COPS2P61201 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPS2P61201 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPS2P61201 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPS2P61201 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPS2P61201 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPS2P61201 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPS2P61201 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COPS2P61201 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
COPS2P61201 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
COPS2P61201 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
COPS2P61201 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPS2P61201 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPS2P61201 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPS2P61201 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
COPS2P61201 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPS2P61201 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPS2P61201 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPS2P61201 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPS2P61201 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COPS2P61201 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPS2P61201 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPS2P61201 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
COPS2P61201 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPS2P61201 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPS2P61201 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPS2P61201 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPS2P61201 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
COPS2P61201 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPS2P61201 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPS2P61201 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPS2P61201 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPS2P61201 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COPS2P61201 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPS2P61201 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPS2P61201 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPS2P61201 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPS2P61201 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPS2P61201 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
COPS2P61201 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPS2P61201 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
COPS2P61201 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
COPS2P61201 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPS2P61201 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPS2P61201 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPS2P61201 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPS2P61201 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPS2P61201 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPS2P61201 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COPS2P61201 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms