Protein–RNA interactions for Protein: P61165

TMEM258, Transmembrane protein 258, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM258P61165 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
TMEM258P61165 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
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TMEM258P61165 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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TMEM258P61165 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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TMEM258P61165 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
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TMEM258P61165 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
TMEM258P61165 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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