Protein–RNA interactions for Protein: P57764

GSDMD, Gasdermin-D, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSDMDP57764 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GSDMDP57764 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GSDMDP57764 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms