Protein–RNA interactions for Protein: P56693

SOX10, Transcription factor SOX-10, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX10P56693 IGFALS-203ENST00000568221 730 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SOX10P56693 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SOX10P56693 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SOX10P56693 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SOX10P56693 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SOX10P56693 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SOX10P56693 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOX10P56693 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOX10P56693 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOX10P56693 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOX10P56693 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOX10P56693 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOX10P56693 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOX10P56693 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOX10P56693 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOX10P56693 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOX10P56693 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOX10P56693 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOX10P56693 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SOX10P56693 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOX10P56693 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOX10P56693 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOX10P56693 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOX10P56693 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOX10P56693 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOX10P56693 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOX10P56693 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOX10P56693 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOX10P56693 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOX10P56693 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOX10P56693 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SOX10P56693 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOX10P56693 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOX10P56693 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SOX10P56693 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOX10P56693 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOX10P56693 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOX10P56693 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOX10P56693 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SOX10P56693 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOX10P56693 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOX10P56693 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOX10P56693 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOX10P56693 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOX10P56693 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SOX10P56693 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SOX10P56693 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SOX10P56693 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SOX10P56693 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SOX10P56693 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SOX10P56693 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SOX10P56693 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SOX10P56693 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SOX10P56693 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOX10P56693 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOX10P56693 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOX10P56693 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOX10P56693 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOX10P56693 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOX10P56693 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOX10P56693 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOX10P56693 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SOX10P56693 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOX10P56693 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOX10P56693 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOX10P56693 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOX10P56693 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOX10P56693 AL512625.3-202ENST00000591993 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOX10P56693 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOX10P56693 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOX10P56693 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SOX10P56693 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SOX10P56693 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SOX10P56693 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SOX10P56693 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SOX10P56693 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
SOX10P56693 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
SOX10P56693 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX10P56693 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX10P56693 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX10P56693 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX10P56693 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX10P56693 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX10P56693 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX10P56693 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX10P56693 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX10P56693 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX10P56693 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SOX10P56693 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOX10P56693 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOX10P56693 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOX10P56693 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOX10P56693 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOX10P56693 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
SOX10P56693 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOX10P56693 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOX10P56693 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SOX10P56693 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOX10P56693 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SOX10P56693 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms