Protein–RNA interactions for Protein: P56597

NME5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME5P56597 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
NME5P56597 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NME5P56597 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
NME5P56597 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NME5P56597 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NME5P56597 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NME5P56597 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NME5P56597 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NME5P56597 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NME5P56597 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NME5P56597 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NME5P56597 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NME5P56597 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NME5P56597 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NME5P56597 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NME5P56597 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NME5P56597 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NME5P56597 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
NME5P56597 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NME5P56597 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
NME5P56597 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NME5P56597 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NME5P56597 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NME5P56597 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NME5P56597 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NME5P56597 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NME5P56597 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NME5P56597 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NME5P56597 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NME5P56597 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NME5P56597 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NME5P56597 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NME5P56597 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
NME5P56597 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
NME5P56597 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NME5P56597 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NME5P56597 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NME5P56597 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NME5P56597 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NME5P56597 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
NME5P56597 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
NME5P56597 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
NME5P56597 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
NME5P56597 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NME5P56597 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NME5P56597 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NME5P56597 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NME5P56597 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NME5P56597 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NME5P56597 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
NME5P56597 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NME5P56597 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NME5P56597 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NME5P56597 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NME5P56597 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NME5P56597 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
NME5P56597 PLEKHJ1-206ENST00000587962 1311 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
NME5P56597 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NME5P56597 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NME5P56597 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NME5P56597 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NME5P56597 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NME5P56597 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NME5P56597 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NME5P56597 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NME5P56597 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NME5P56597 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
NME5P56597 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NME5P56597 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NME5P56597 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NME5P56597 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NME5P56597 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NME5P56597 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
NME5P56597 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC20.75■□□□□ 0.91
NME5P56597 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NME5P56597 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NME5P56597 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NME5P56597 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NME5P56597 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
NME5P56597 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NME5P56597 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NME5P56597 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NME5P56597 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NME5P56597 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NME5P56597 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NME5P56597 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NME5P56597 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
NME5P56597 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NME5P56597 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
NME5P56597 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NME5P56597 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NME5P56597 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NME5P56597 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NME5P56597 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NME5P56597 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
NME5P56597 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NME5P56597 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NME5P56597 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NME5P56597 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
NME5P56597 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms