Protein–RNA interactions for Protein: P55809

OXCT1, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXCT1P55809 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
OXCT1P55809 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
OXCT1P55809 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms