Protein–RNA interactions for Protein: P55773

CCL23, C-C motif chemokine 23, humanhuman

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL23P55773 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCL23P55773 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CCL23P55773 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCL23P55773 STAP2-206ENST00000600324 1508 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CCL23P55773 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCL23P55773 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCL23P55773 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCL23P55773 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCL23P55773 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCL23P55773 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCL23P55773 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCL23P55773 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCL23P55773 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCL23P55773 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCL23P55773 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCL23P55773 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CCL23P55773 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCL23P55773 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCL23P55773 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CCL23P55773 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCL23P55773 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCL23P55773 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCL23P55773 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCL23P55773 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCL23P55773 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCL23P55773 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCL23P55773 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCL23P55773 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCL23P55773 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CCL23P55773 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCL23P55773 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCL23P55773 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCL23P55773 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCL23P55773 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCL23P55773 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCL23P55773 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCL23P55773 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCL23P55773 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCL23P55773 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCL23P55773 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCL23P55773 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCL23P55773 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCL23P55773 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCL23P55773 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCL23P55773 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCL23P55773 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
CCL23P55773 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCL23P55773 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCL23P55773 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCL23P55773 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CCL23P55773 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCL23P55773 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCL23P55773 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCL23P55773 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCL23P55773 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CCL23P55773 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCL23P55773 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCL23P55773 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCL23P55773 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCL23P55773 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCL23P55773 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCL23P55773 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCL23P55773 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCL23P55773 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCL23P55773 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCL23P55773 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCL23P55773 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCL23P55773 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCL23P55773 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCL23P55773 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCL23P55773 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCL23P55773 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCL23P55773 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCL23P55773 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCL23P55773 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCL23P55773 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCL23P55773 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCL23P55773 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCL23P55773 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCL23P55773 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCL23P55773 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCL23P55773 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCL23P55773 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCL23P55773 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCL23P55773 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCL23P55773 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCL23P55773 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCL23P55773 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCL23P55773 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCL23P55773 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCL23P55773 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCL23P55773 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCL23P55773 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCL23P55773 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCL23P55773 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCL23P55773 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCL23P55773 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCL23P55773 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCL23P55773 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CCL23P55773 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms