Protein–RNA interactions for Protein: P54284

CACNB3, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit beta-3, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNB3P54284 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNB3P54284 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CACNB3P54284 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.71
CACNB3P54284 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CACNB3P54284 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 NDUFS3-207ENST00000529276 558 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
CACNB3P54284 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CACNB3P54284 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms