Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP3M2P53677 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
AP3M2P53677 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms