Protein–RNA interactions for Protein: P53621

COPA, Coatomer subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPAP53621 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPAP53621 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPAP53621 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
COPAP53621 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPAP53621 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPAP53621 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
COPAP53621 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPAP53621 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPAP53621 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPAP53621 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPAP53621 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPAP53621 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPAP53621 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPAP53621 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
COPAP53621 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPAP53621 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPAP53621 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPAP53621 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
COPAP53621 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPAP53621 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPAP53621 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPAP53621 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
COPAP53621 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPAP53621 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPAP53621 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPAP53621 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPAP53621 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPAP53621 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPAP53621 AC068587.7-201ENST00000641602 218 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
COPAP53621 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPAP53621 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPAP53621 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPAP53621 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPAP53621 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPAP53621 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPAP53621 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
COPAP53621 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COPAP53621 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COPAP53621 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COPAP53621 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
COPAP53621 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPAP53621 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPAP53621 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPAP53621 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPAP53621 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPAP53621 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
COPAP53621 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPAP53621 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPAP53621 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPAP53621 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPAP53621 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
COPAP53621 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPAP53621 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPAP53621 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPAP53621 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPAP53621 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPAP53621 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPAP53621 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPAP53621 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPAP53621 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPAP53621 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPAP53621 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPAP53621 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPAP53621 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPAP53621 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPAP53621 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
COPAP53621 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPAP53621 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPAP53621 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPAP53621 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPAP53621 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
COPAP53621 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPAP53621 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPAP53621 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPAP53621 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPAP53621 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPAP53621 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPAP53621 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPAP53621 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPAP53621 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPAP53621 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPAP53621 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
COPAP53621 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPAP53621 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPAP53621 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPAP53621 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPAP53621 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPAP53621 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
COPAP53621 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPAP53621 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPAP53621 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPAP53621 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPAP53621 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPAP53621 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPAP53621 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPAP53621 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPAP53621 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPAP53621 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPAP53621 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
COPAP53621 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms