Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PGGT1BP53609 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGGT1BP53609 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGGT1BP53609 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGGT1BP53609 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PGGT1BP53609 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGGT1BP53609 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGGT1BP53609 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGGT1BP53609 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGGT1BP53609 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGGT1BP53609 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGGT1BP53609 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGGT1BP53609 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PGGT1BP53609 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGGT1BP53609 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGGT1BP53609 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGGT1BP53609 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGGT1BP53609 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGGT1BP53609 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGGT1BP53609 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGGT1BP53609 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PGGT1BP53609 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGGT1BP53609 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PGGT1BP53609 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
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PGGT1BP53609 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGGT1BP53609 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PGGT1BP53609 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGGT1BP53609 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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PGGT1BP53609 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGGT1BP53609 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
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PGGT1BP53609 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGGT1BP53609 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGGT1BP53609 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGGT1BP53609 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGGT1BP53609 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PGGT1BP53609 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGGT1BP53609 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGGT1BP53609 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGGT1BP53609 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGGT1BP53609 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGGT1BP53609 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGGT1BP53609 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGGT1BP53609 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGGT1BP53609 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PGGT1BP53609 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PGGT1BP53609 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGGT1BP53609 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGGT1BP53609 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGGT1BP53609 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGGT1BP53609 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGGT1BP53609 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGGT1BP53609 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGGT1BP53609 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGGT1BP53609 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGGT1BP53609 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PGGT1BP53609 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
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