Protein–RNA interactions for Protein: P52954

LBX1, Transcription factor LBX1, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LBX1P52954 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LBX1P52954 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LBX1P52954 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LBX1P52954 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LBX1P52954 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LBX1P52954 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LBX1P52954 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LBX1P52954 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LBX1P52954 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LBX1P52954 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LBX1P52954 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LBX1P52954 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LBX1P52954 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LBX1P52954 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LBX1P52954 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LBX1P52954 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LBX1P52954 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LBX1P52954 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LBX1P52954 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LBX1P52954 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LBX1P52954 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LBX1P52954 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LBX1P52954 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LBX1P52954 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LBX1P52954 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LBX1P52954 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LBX1P52954 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LBX1P52954 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LBX1P52954 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LBX1P52954 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LBX1P52954 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LBX1P52954 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LBX1P52954 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LBX1P52954 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LBX1P52954 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LBX1P52954 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LBX1P52954 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LBX1P52954 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LBX1P52954 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LBX1P52954 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LBX1P52954 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LBX1P52954 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LBX1P52954 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LBX1P52954 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LBX1P52954 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LBX1P52954 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LBX1P52954 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LBX1P52954 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LBX1P52954 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LBX1P52954 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LBX1P52954 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LBX1P52954 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LBX1P52954 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LBX1P52954 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LBX1P52954 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LBX1P52954 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LBX1P52954 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LBX1P52954 AC004687.1-201ENST00000579003 1625 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LBX1P52954 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
LBX1P52954 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LBX1P52954 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LBX1P52954 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LBX1P52954 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LBX1P52954 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LBX1P52954 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
LBX1P52954 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LBX1P52954 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LBX1P52954 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LBX1P52954 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LBX1P52954 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LBX1P52954 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LBX1P52954 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LBX1P52954 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LBX1P52954 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LBX1P52954 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LBX1P52954 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LBX1P52954 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LBX1P52954 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LBX1P52954 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LBX1P52954 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LBX1P52954 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
LBX1P52954 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LBX1P52954 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LBX1P52954 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LBX1P52954 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LBX1P52954 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LBX1P52954 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LBX1P52954 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LBX1P52954 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LBX1P52954 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LBX1P52954 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LBX1P52954 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
LBX1P52954 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LBX1P52954 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
LBX1P52954 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LBX1P52954 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
LBX1P52954 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LBX1P52954 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LBX1P52954 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
LBX1P52954 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms