Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 DUSP9-202ENST00000370167 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ZNF135P52742 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF135P52742 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF135P52742 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF135P52742 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF135P52742 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF135P52742 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF135P52742 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF135P52742 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF135P52742 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF135P52742 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ZNF135P52742 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF135P52742 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF135P52742 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF135P52742 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF135P52742 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF135P52742 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF135P52742 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF135P52742 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF135P52742 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF135P52742 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF135P52742 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF135P52742 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ZNF135P52742 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms