Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
GPC3P51654 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPC3P51654 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPC3P51654 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPC3P51654 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPC3P51654 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
GPC3P51654 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPC3P51654 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPC3P51654 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPC3P51654 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPC3P51654 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPC3P51654 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
GPC3P51654 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
GPC3P51654 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPC3P51654 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPC3P51654 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPC3P51654 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPC3P51654 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPC3P51654 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPC3P51654 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
GPC3P51654 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
GPC3P51654 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
GPC3P51654 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPC3P51654 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPC3P51654 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPC3P51654 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPC3P51654 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPC3P51654 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPC3P51654 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPC3P51654 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPC3P51654 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPC3P51654 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GPC3P51654 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
GPC3P51654 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPC3P51654 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
GPC3P51654 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPC3P51654 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPC3P51654 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPC3P51654 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPC3P51654 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPC3P51654 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
GPC3P51654 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPC3P51654 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPC3P51654 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPC3P51654 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPC3P51654 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPC3P51654 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
GPC3P51654 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPC3P51654 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPC3P51654 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPC3P51654 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPC3P51654 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPC3P51654 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPC3P51654 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GPC3P51654 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPC3P51654 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
GPC3P51654 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
GPC3P51654 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPC3P51654 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPC3P51654 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPC3P51654 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPC3P51654 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPC3P51654 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPC3P51654 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPC3P51654 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPC3P51654 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPC3P51654 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPC3P51654 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPC3P51654 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPC3P51654 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPC3P51654 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPC3P51654 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPC3P51654 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPC3P51654 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPC3P51654 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPC3P51654 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPC3P51654 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
GPC3P51654 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPC3P51654 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPC3P51654 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPC3P51654 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPC3P51654 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GPC3P51654 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPC3P51654 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPC3P51654 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
GPC3P51654 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPC3P51654 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPC3P51654 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
GPC3P51654 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPC3P51654 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPC3P51654 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPC3P51654 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
GPC3P51654 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPC3P51654 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPC3P51654 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPC3P51654 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
GPC3P51654 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
GPC3P51654 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPC3P51654 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPC3P51654 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms