Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DAP3P51398 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DAP3P51398 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DAP3P51398 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DAP3P51398 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DAP3P51398 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
DAP3P51398 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
DAP3P51398 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
DAP3P51398 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
DAP3P51398 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
DAP3P51398 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
DAP3P51398 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DAP3P51398 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DAP3P51398 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DAP3P51398 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DAP3P51398 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
DAP3P51398 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DAP3P51398 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
DAP3P51398 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DAP3P51398 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
DAP3P51398 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DAP3P51398 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DAP3P51398 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DAP3P51398 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DAP3P51398 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DAP3P51398 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
DAP3P51398 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DAP3P51398 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DAP3P51398 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DAP3P51398 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
DAP3P51398 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DAP3P51398 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DAP3P51398 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DAP3P51398 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DAP3P51398 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DAP3P51398 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
DAP3P51398 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
DAP3P51398 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DAP3P51398 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DAP3P51398 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DAP3P51398 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DAP3P51398 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DAP3P51398 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DAP3P51398 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DAP3P51398 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DAP3P51398 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
DAP3P51398 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DAP3P51398 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DAP3P51398 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DAP3P51398 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DAP3P51398 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
DAP3P51398 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
DAP3P51398 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DAP3P51398 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DAP3P51398 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DAP3P51398 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DAP3P51398 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DAP3P51398 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
DAP3P51398 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
DAP3P51398 EIF2B4-211ENST00000616081 1754 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DAP3P51398 SMUG1-215ENST00000508394 1697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
DAP3P51398 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DAP3P51398 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DAP3P51398 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DAP3P51398 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DAP3P51398 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DAP3P51398 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DAP3P51398 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DAP3P51398 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DAP3P51398 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DAP3P51398 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DAP3P51398 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
DAP3P51398 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
DAP3P51398 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
DAP3P51398 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DAP3P51398 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DAP3P51398 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DAP3P51398 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DAP3P51398 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DAP3P51398 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DAP3P51398 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DAP3P51398 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DAP3P51398 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
DAP3P51398 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DAP3P51398 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DAP3P51398 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DAP3P51398 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DAP3P51398 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DAP3P51398 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
DAP3P51398 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
DAP3P51398 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
DAP3P51398 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DAP3P51398 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DAP3P51398 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DAP3P51398 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
DAP3P51398 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DAP3P51398 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DAP3P51398 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DAP3P51398 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
DAP3P51398 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms