Protein–RNA interactions for Protein: P50440

GATM, Glycine amidinotransferase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATMP50440 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GATMP50440 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GATMP50440 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GATMP50440 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GATMP50440 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GATMP50440 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GATMP50440 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GATMP50440 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
GATMP50440 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GATMP50440 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GATMP50440 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GATMP50440 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GATMP50440 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GATMP50440 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GATMP50440 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GATMP50440 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GATMP50440 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GATMP50440 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GATMP50440 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GATMP50440 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GATMP50440 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GATMP50440 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GATMP50440 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GATMP50440 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GATMP50440 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GATMP50440 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GATMP50440 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GATMP50440 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GATMP50440 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GATMP50440 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GATMP50440 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GATMP50440 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GATMP50440 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GATMP50440 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GATMP50440 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GATMP50440 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GATMP50440 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GATMP50440 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GATMP50440 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GATMP50440 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GATMP50440 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GATMP50440 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GATMP50440 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GATMP50440 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GATMP50440 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GATMP50440 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GATMP50440 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
GATMP50440 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GATMP50440 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GATMP50440 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GATMP50440 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GATMP50440 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GATMP50440 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GATMP50440 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GATMP50440 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GATMP50440 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GATMP50440 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GATMP50440 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GATMP50440 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GATMP50440 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GATMP50440 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GATMP50440 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GATMP50440 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GATMP50440 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GATMP50440 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
GATMP50440 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GATMP50440 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GATMP50440 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GATMP50440 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GATMP50440 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GATMP50440 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GATMP50440 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GATMP50440 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GATMP50440 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GATMP50440 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GATMP50440 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GATMP50440 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GATMP50440 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GATMP50440 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
GATMP50440 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GATMP50440 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GATMP50440 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GATMP50440 TMEM5-201ENST00000261234 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GATMP50440 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GATMP50440 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GATMP50440 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GATMP50440 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GATMP50440 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GATMP50440 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GATMP50440 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GATMP50440 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GATMP50440 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GATMP50440 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GATMP50440 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
GATMP50440 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
GATMP50440 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GATMP50440 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GATMP50440 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GATMP50440 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GATMP50440 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms